Pada Peringkat awal penubuhan Suruhanjaya pada 1967, urusan Kewangan dikendalikan oleh Bahagian Khidmat Pengurusan dan Pentadbiran Am (BPSMPA).
Pada tahun 2013, Bahagian Kewangan dipisahkan daripada Bahagian Pengurusan Sumber Manusia dan Pentadbiran Am dikenali sebagai Bahagian Kewangan, Akaun dan Pembangunan. Bahagian ini dibahagi kepada empat (4) cawangan utama seperti berikut:-
Cawangan Pentadbiran Pengurusan
Cawangan Belanjawan
Cawangan Pembangunan
Cawangan Akaun, Bayaran dan Perolehan
Bahagian Kewangan, Akaun dan Pembangunan telah dipertanggungjawabkan untuk menjalankan tugas-tugas berkaitan Pengurusan Kewangan seperti pengurusan bajet, pengurusan perolehan, pengurusan Akaun dan bayaran serta pengurusan projek Pembangunan SPRM.
